Mario y Luigi se enfrentan una nueva amenaza: Bowser Jr., quién está decidido liberar a su padre del cautiverio y restaurar el legado familiar. Junto con nuevos y viejos compañeros, los hermanos viajan a través de las estrellas para detener la cruzada del joven heredero.
El profesor de ciencias Ryland Grace despierta en una nave espacial a años luz de su hogar sin recordar quién es ni cómo llegó allí. A medida que recupera la memoria, comienza a descubrir su misión: resolver el enigma de la misteriosa sustancia que está causando la extinción del sol.
Mientras celebra su cumpleaños número 21, Kara Zor-El viaja por la galaxia con su perro Krypto, durante el cual conoce a la joven Ruthye Marye Knoll y emprende una «búsqueda asesina de venganza».